O objetivo dos anuários é divulgar os resultados das atividades de defesa sanitária animal e vigilância epidemiológica realizadas durante o ano.
Nos anuários constam informações de todos os municípios do Estado, que são utilizadas como instrumento de avaliação, permitindo a adoção de medidas que auxiliem no processo coletivo de construção de um sistema de vigilância epidemiológica estadual.